Mae dadansoddiad purdeb peptid yn cael ei berfformio fel arfer gan ddefnyddio Cromatograffaeth Hylif Perfformiad Uchel (HPLC). Prif amcan dadansoddiad sbectrometreg màs yw cadarnhau'r pwysau moleciwlaidd; ar hyn o bryd, y prif dechnegau a ddefnyddir ar gyfer dadansoddi peptidau yw Sbectrometreg Màs Ïoneiddiad Electrospray (ESI-MS) a Matrics-Sbectrometreg Màs Assugniad/Ioneiddiad â Chymorth (MALDI-MS).
Mae dadansoddiad cyfansoddiad asid amino yn datgelu'r mathau a'r meintiau o asidau amino sy'n bresennol mewn peptid, a'r egwyddor sylfaenol sy'n sail i ddadansoddiad dilyniant asid amino yw diraddiad Edman.
Mae dulliau ar gyfer adnabod adeileddau eilaidd peptid yn cynnwys Dichroism Cylchlythyr (CD), Cyseiniant Magnetig Niwclear (NMR), diffreithiant pelydr X-, ymhlith eraill.
Yn ystod y broses synthesis cyfnod solet, mae'n bosibl y bydd amrywiol amhureddau megis dilyniannau dileu, dilyniannau mewnosod, peptidau cypledig anghywir, peptidau epimerized, a pheptidau ocsidiedig-yn cael eu cynhyrchu. Mae adnabod amhureddau cysylltiedig â pheptid o'r fath-yn nodweddiadol yn cael ei gyflawni gan ddefnyddio Cromatograffaeth Hylif -Sbectrometreg Màs Tandem (LC/MS/MS); Mae LC{7}}MS yn galluogi pennu màs peptid yn gywir, tra bod MS/MS yn cael ei ddefnyddio i egluro ei ddilyniant. Yn ogystal, gellir defnyddio technegau cromatograffig HPLC i gyflawni gwahanu a chanfod yn effeithiol.
Mewn synthesis peptid cyfnod solet, caiff effeithlonrwydd cyplu ei asesu'n bennaf trwy ganfod presenoldeb grwpiau amino rhydd ar y resin; gelwir y dull canfod hwn yn brawf Kaiser (neu brawf Ninhydrin). Os oes grwpiau amino rhad ac am ddim yn bresennol, mae lliw brown coch neu las yn datblygu.